關于等離子空氣消毒機的消毒機理，其實目前還沒有統一定論，但是根據試驗出現了各種有關等離子空氣消毒機消毒機理的假設，無論是從物理還是化學方面可歸根就是三種，在這里北京藍博同創環保科技有限公司介紹等離子空氣消毒機三大消毒原理。
1、活性基團的作用：等離子體中含有的大量活性氧離子和高能自由基團等成份，極容易與細菌、霉菌以及芽孢、病毒中蛋白和核酸發生化學反應，能夠摧毀微生物以及擾亂微生物的生存功能，使各類微生物死亡。
2、高速粒子擊穿作用：在滅菌實驗后，通過電鏡觀察經等離子體作用后的細菌菌體和病毒顆粒圖像，均呈現出千瘡百孔狀，這就是由具有高動能的電子以及離子產生的擊穿蝕刻效應所致，即等離子體中高速粒子可打破微生物分子的化學鍵，最后生成揮發性的化合物（如COx和CHx等）。
3、紫外線的作用：在激發物質形成等離子體的過程中，伴隨著有一部分紫外線產生，這種高能紫外光子被微生物或者是病毒中蛋白質所吸收，直接破壞微生物的基因物質致使其分子變性失去活性。研究表明在單一氣體中， 氣體對細菌孢子的殺滅作用不盡相同，殺菌效果強弱為O2、CO2、H2、Ar和N2；而利用混合氣體激發等離子體，其殺菌消毒效果往往比單一中性氣體要好得多。
