壁掛式醫用空氣消毒機與壁掛式空調室內機的工作原理類似。相同點都是利用風機將房間中的空氣吸入機器內部進行處理后，再將處理后的空氣送回到房間，空氣快速循環流動從而達到各自的目的。不同的是壁掛式空調室內機進行熱交換，而壁掛式醫用空氣消毒機進行空氣凈化消毒。由此可見壁掛式醫用空氣消毒機與壁掛式空調室內機只是機器內部的差異，而兩者外觀酷似。
房間內空氣需要進行快速循環流動：壁掛式醫用空氣消毒機與壁掛式空調室內機在這方面的目標是完全一致的。達到這個目標由兩方面決定，即機器的進風方式和出風方式，尤其是機器的出風方式更為重要。機器的出風口首先應該對準房間的大部分區域，然后機器應該具有廣角度擺風功能，從而攪動房間內的空氣快速循環流動起來，防止房間內空氣流動出現死角。當然壁掛式醫用空氣消毒機單一方向的進風和出風方式（比如下進風和上出風）是否就達不到房間內的空氣凈化和消毒效果呢，這也不能完全否認的，可以通過增加消毒機功率和增加消毒機開機的時間來彌補，只是能耗更高。
需要更快捷的清洗或更換過濾網：壁掛式醫用空氣消毒機與壁掛式空調室內機都需要更快捷的清洗或更換過濾網，當壁掛式醫用空氣消毒機和壁掛式空調室內機使用一段時間后，過濾網需要清洗或更換，打開機器蓋板取下過濾網，把過濾網洗干凈，用電吹風機把過濾網吹干，然后再把過濾網上回機器，最后蓋上機器蓋板即可。由此壁掛式醫用空氣消毒機類似于壁掛式空調室內機上蓋板的設計更能夠快捷的清洗或更換過濾網。
